Создатели Shadow Empire решили смешать 4X стратегию, варгейм RPG и элементы рогалика. В этой игре все происходит пошагово. Геймер попадает на опустошенную планету, где многие объекты будут выглядеть для него чужеродно. Он, руководя маленькой нацией, должен завоевать её. Пользователи могут сражаться с компьютером и между собой.

В проекте большой упор делается на процедурную генерацию. Здесь рандомно создаются не только карты, но и технологии, модели юнитов и типы военных формирований. Все стороны конфликта изначально являются отсталыми в плане прогресса. Постепенно они совершенствуют науку и совершают открытия. Изучение технологического древа даст доступ к строительству роботов, генераторов щитов, ядерного оружия, лазерных пушек и другого вооружения.

Император взаимодействует со своими лидерами, которые управляют зонами, прокачиваются и получают навыки (умений тут около 40). Общение с ними выстроено по принципу ролевых игр. Если брезговать их потребностями, то они могут подбить народ на восстание, начать брать взятки или уйти в отставку. В Shadow Empire на подконтрольных юзеру территориях постоянно случаются форс-мажорные события. Например: появление сект или преступных синдикатов. Игроку позволят самому решать, что с ними делать.