Zero-K — инди-стратегия в реальном времени, где масштабные сражения разворачиваются на суше, в воде и в воздухе. Физика и баллистика здесь проработаны, а поле боя меняется по ходу столкновений: грунт можно ровнять и переделывать под тактический план. Игроки создают воронки на пути вражеских танков, роют траншеи, насыпают холмы и укрывают бойцов за ними от обстрела. Можно также прорезать в суше водные проходы для флота или занять высоты, чтобы улучшить обзор и увеличить дальность стрельбы.

Игра продолжает идеи Total Annihilation и Supreme Commander. В распоряжении — свыше 100 типов боевых единиц, которые важно расставлять с учётом риска задеть союзников огнём. Отряды принимают любые построения, умеют кайтить и вести огонь зигзагами. Под управлением игрока находятся дроны, боты и командир; строить производственные здания для юнитов и техники может только командир. Победа требует уничтожить вражеских командиров и уберечь своего. Для этого можно превосходить противника числом, собрать небольшую армию и полагаться на микроменеджмент либо вложить все ресурсы в развитие главного персонажа и атаковать в одиночку вражескую базу.

Кампания включает 70 миссий, а число доступных карт приближается к сотне. Сражаться можно против ботов или других игроков; новичкам доступно обучение. В сетевой игре предусмотрены кооператив, дуэли, матчи с командами по 16 человек с каждой стороны и режим, где каждый участник выступает сам за себя. Есть также ладдер и турниры, а за боями можно наблюдать и просматривать повторы.