Total War: WARHAMMER 3 сочетает пошаговое управление стратегией с боями в реальном времени. Игрок перемещает собранную армию по глобальной карте, стремится занять все территории, добывает ресурсы, нанимает бойцов и строит поселения. С разными фракциями можно вести переговоры, договариваться о союзе или начинать войну. Экономика действует по принципам TBS, а сражения проходят в режиме реального времени. В игре представлены восемь рас и свыше сотни типов отрядов.

Среди фракций — Кислев, вдохновлённый средневековой Россией, и Великий Катай, напоминающий древний Китай. Демоны Кхорна несут кровопролитие, гнев и войну; Нурглы связаны с разложением и отчаянием, Тзинч стремится к переменам, а Слаанеш — это воины, одержимые похотью и властью. Демоны Хаоса неделимого объединяют четыре предыдущих божества. В Королевстве огров сражаются могучие зелёные воины.

Кампания проходит во Владениях Хаоса — месте, где сосредоточена вся магия вселенной Warhammer Fantasy. Её глобальная карта в несколько раз больше области Вихря бури. Разработчики уделили особое внимание повествованию, создав более связную и сложную историю.

Переработана система осад: теперь на происходящее влияют особенности отрядов и тип местности. Появились новые уровни и припасы, которые накапливаются со временем и дают дополнительные преимущества при штурме вражеского замка. Используя накопленное, прямо в ходе боя можно строить баррикады, устанавливать ловушки и возводить защитные башни.

На выбор доступно более десяти легендарных лордов с особыми свойствами, включая Дракона-человека, Воителя-демона и Ледяную королеву. Их внешний облик можно изменять по своему вкусу.