Вдохновением для Scene Investigators послужили детективные фильмы и известные преступления. Действие происходит в ближайшем будущем: игрок управляет стажёром, который хочет получить детективную лицензию и серьёзные дела. На пути к этой цели его ждут учебные расследования разной сложности. Нужно не просто осматривать криминальные случаи, а раскрывать их, полагаясь на дедукцию и решая логические задачи и головоломки.

Работая на месте происшествия, стажёр изучает необычные сцены, ищет улики и скрытые детали, отмечает всё подозрительное и формирует собственные версии. Подсказки и беседы со свидетелями помогают выйти на преступника и восстановить обстоятельства случившегося. Перемещение по месту преступления и взаимодействие с окружением раскрывают повествование; внимательность и рассуждение позволяют соединить факты и проследить связи между убийцами и жертвами. Например, направление, в котором пуля отскочила от стены, может оказаться странным с учётом положения убитого.

Можно расследовать вместе: в кооперативном режиме на одном экране два или больше участников изучают сцены и решают головоломки.