Теневое агентство предало своего бывшего исполнителя. Killer Bean отвечает на это самостоятельной войной против организации: разумному герою-бобу противостоит вооружённая армия, располагающая базой и тяжёлой техникой. Прежние наниматели пытаются устранить беглеца, а он стремится добраться до них.

Бои используют навыки героя и несколько видов оружия. Бронированные цели имеют уязвимые участки, по которым можно прицелиться, чтобы вывести технику из строя. Численный перевес врага заставляет внимательно выбирать момент и направление атаки.

При новом одиночном заходе меняются задания, состав и размещение противников, а также поведение встречных персонажей. Знакомые герои франшизы способны помочь или осложнить путь предательством. Поэтому повторная попытка требует заново оценивать обстановку и отношения с теми, кого удалось встретить на карте.