Whiskerwood — градостроительная стратегия о мышах, которым нужно создать поселение, находясь под властью кошек. На островах мало места: колонию расширяют в стороны, вырубают помещения в скалах и строят вверх. Такая застройка требует разветвлённой инфраструктуры — конвейеров, лифтов и труб, по которым перемещаются ресурсы и доставляются необходимые жителям товары. Производственные цепочки и автоматизация помогают превратить небольшое убежище в крупный процветающий город.

У мышей-поселенцев есть индивидуальные черты и гильдии, от которых зависит их эффективность в различных занятиях. Игрок решает, подчиняться ли всё возрастающим требованиям кошачьих хозяев: статуи в их честь улучшают трудовую отдачу, но вредят морали. Другой вариант — сопротивляться. Торговля с иными объединениями грызунов и пиратами может помочь колонии добиться самостоятельности. От выбора зависит её участь: продолжать служить кошкам или восстать против них.

Для развития поселения предстоит учитывать погоду: штормы и морозы могут погубить урожай. Задачи следует поручать мышам с оглядкой на их способности и гильдейскую принадлежность. Ландшафт можно менять ради удобства строительства либо приспосабливать постройки к естественному рельефу. При этом нужно сочетать удовлетворение основных нужд мышей с исполнением кошачьих приказов. Исследовательские лаборатории позволяют изучать технологии, открывая новые постройки и способы производства.