В 1996 году Роберт Чен отправляется в школу с видеокамерой: там пропала его младшая сестра, а вслед за ней — и другие ученики. Внутри мужчина обнаруживает, что школа превратилась в лабиринт коридоров и классов, где обитают аномалии. Некоторые из них безвредны и лишь выглядят необычно, другие же опасны.

The Classrooms — ретро-стилизованный психологический хоррор на выживание от первого лица с VHS-фильтром. Его лиминальные школьные пространства генерируются процедурно: при каждом новом прохождении карта создаётся заново. По словам разработчиков, возможны миллиарды её вариантов. Игрок исследует встречающихся на этапах существ, каждое из которых обладает своими свойствами и механиками. Сведения о существах, явлениях и другие полезные данные попадают в кодекс. Инвентарь предназначен для найденных ключей, предметов и снаряжения.

Герой умеет ходить и плавать, подбирать, применять и бросать вещи, включать фонарик, взаимодействовать с окружением и заглядывать за углы.