Эстель и Джошуа отправляются в первое путешествие по Королевству Либерл. Они — младшие Брейсеры, призванные поддерживать мир в регионе: герои переходят из города в город, берутся за поручения и улаживают местные конфликты. Такая работа становится для них тренировкой, но не единственной причиной пути: они также ищут своего пропавшего отца Кассиуса. В дороге им встречаются союзники, случаются значимые расставания, а впереди всё яснее проступает великая судьба.

В Sora no Kiseki the 1st доступны два способа сражаться: можно вступать в непосредственные схватки прямо на локациях или выбирать пошаговые тактические бои. В последних действия союзников и врагов следуют очередности ходов. Герои располагают особыми приёмами, среди которых уникальные атаки Crafts и магия стихий Arts. Игровой мир выполнен в трёхмерном пространстве; между городами и открытыми полями можно перемещаться без переходных прерываний.

Отношения Эстель и Джошуа с жителями Либерла складываются в ходе многочисленных заданий и разноплановых дополнительных занятий. Новые знакомства и укрепляющиеся связи влияют на их путь и выводят историю за пределы повседневных обязанностей Брейсеров. Центральная линия показывает, как взрослеют герои и приближаются к разгадке судьбы, ждущей их в конце дороги: начавшаяся как личная миссия, их история становится куда масштабнее.