Project Cobalt — приключенческий экшен о выживании. Завязка истории — подписание рокового контракта в стерильной лаборатории под наблюдением безмолвных врачей. Затем герой оказывается на враждебном острове, где ему угрожают дикая природа и последствия загадочного эксперимента, который закончился провалом.

Чтобы выжить, придётся противостоять голоду, внезапным недугам и сильному переутомлению, рассчитывать силы и переживать разрушительные штормы. Одновременно нужно развивать автономный лагерь и добывать необходимые ресурсы: вскрывать грузовые контейнеры ради медикаментов и оставленного оборудования, разрабатывать рудные жилы для изготовления инструментов, охотиться на островных животных ради мяса и собирать экипировку из найденного сырья. Поиск скрытых сведений о катастрофе поможет выяснить истинные причины эксперимента. Состояние персонажа можно сохранить в любой момент, а управление не устанавливает обязательного лимита времени на ввод действий.