В Mycopsychosys: Project Jupiter новобранец Уго оказывается в эпицентре смертоносной эпидемии, которая быстро распространяется по новым регионам страны. Его привычная работа в департаменте контроля вспышек — бумажная волокита, дотошные инспекции под мерцающими лампами и тяжелая бюрократия — сменяется опасными вылазками к заброшенным объектам. Уго предстоит искать ответы вместе с назначенным ему напарником, чей сложный характер превращает совместную работу в испытание.

Повествование чередует удушающую атмосферу кабинетов с рискованными экспедициями. Чтобы разобраться в происходящем, нужно сопоставлять разрозненные улики, решать логические задачи и противостоять загадочной заразе, меняющей человеческое общество. Встречи с подозрительными собеседниками требуют осторожности: их истинные намерения скрыты.

Во время вылазок приходится искать зацепки в заражённых районах и на заброшенных объектах, а убежища защищать, укрепляя окна подручными средствами. Разговоры помогают распознавать опасных имитаторов среди выживших. Решения Уго меняют дальнейшее развитие истории и её финал, при этом работать нужно вместе с непростым напарником.