Прибыль от торговли — основной двигатель прогресса в Moonlighter 2: The Endless Vault. Вырученные средства можно потратить на улучшенное оружие и доспехи или реинвестировать в предприятия других жителей Tresna, например в кузницу или лавку ведьмы. Такие вложения напрямую способствуют развитию города: по мере его процветания появляются новые жители, а значит, увеличивается число потенциальных покупателей.

Во время экспедиций игрок исследует процедурно создаваемые измерения, собирает ценные реликвии и противостоит враждебным существам. Углублённое исследование подземелья может принести больше сокровищ, но вместе с этим возрастает угроза потерять все собранные товары. Чтобы вернуться с полным рюкзаком артефактов, нужно преодолеть опасности и выжить.

Игра чередует вылазки в подземелья с коммерцией в деревне Tresna. После каждой экспедиции фокус смещается на управление личным магазином: игрок выставляет добычу, ведёт переговоры с покупателями и назначает цены, стремясь заключить выгодные сделки.

Центральный вызов проекта — Бесконечное Хранилище, артефакт, испытания которого проверяют коммерческую хватку игрока в высокодоходных торговых сессиях. Их преодоление приносит существенные улучшения для города. Успех в бизнесе подпитывает развитие поселения и открывает новые игровые возможности.