В Moo Who? одна команда охотится на другую: игроки могут быть либо зверями, скрывающимися от преследования, либо вооружёнными охотниками. Взяв под управление корову, свинью, курицу или овцу, нужно смешаться с компьютерным стадом и как можно точнее перенимать повадки животных. Чтобы оставаться в живых, зверям приходится через микрофон регулярно мычать, кудахтать, хрюкать или блеять. Если долго не подавать голоса, срабатывает механика акустического давления: над молчуном появляется жужжащий рой мух, и замаскированного обитателя фермы становится проще обнаружить.

Охотники с дробовиками обследуют локации и пытаются распознать самозванцев по особенностям их голосов. Выстрел в настоящее животное расходует боеприпас, а устранение соперника приближает охотников к победе.

Матчи проходят короткими раундами для компании от двух до восьми игроков. Подозрения, ошибочные обвинения и паническое бегство перепуганных зверей задают им напряжённый тон. Необходимость непрерывно изображать животных как можно убедительнее делает происходящее ещё абсурднее по мере роста стресса.