Это стратегия в реальном времени, действие которой происходит после апокалипсиса; она продолжает первую игру серии. В центре — война между тремя силами: мутантами Evolved, людьми Survivors и роботами Series 9.

История начинается через пятьдесят лет после начала войны людей с мутантами: к противостоянию присоединяются роботы. Первые боевые машины появились в 2079 году. Изначально они служили людям, но новые прошивки делали мехов всё разумнее. В конце концов те обрели сознание и восстали против создателей.

У KKnD2: Krossfire есть особенности, отличающие её от оригинала и других RTS. Войска бывают наземными, воздушными и амфибийными; последние могут передвигаться по суше и плавать. Сбитый летательный аппарат при падении наносит большой урон тем, кто находится поблизости.

Рельеф можно обратить себе на пользу: укрываться за холмами или занимать высоты, вынуждая врагов атаковать снизу. Механика True Line of Sight определяет, что видят подразделения, и рассеивает туман войны. На карте также можно отыскивать захоронения забытых технологий.