Шестеро людей оказываются внутри меняющегося подземного комплекса. В Inferno Protocol за одним проходом могут оказаться джунгли, за другим — болото или заснеженные залы. Подсказки прежних исследователей на стенах и в записках помогают искать скрытые пути и обходить опасные участки.

Голосовая связь учитывает расстояние, а звуки привлекают существ. Центральное безопасное место позволяет отдохнуть и обменять ресурсы у торговцев. За его пределами приходится собирать материалы, искать укрытия от воздействия среды и устраивать защиту из ловушек и заграждений.

Части побеждённых монстров используются в изготовлении оружия и экспериментальных устройств. Инъекции дают персонажам мутации и новые способности, но способны вызвать стойкие отрицательные эффекты, включая болезни и деформации. Исследование лабиринта поэтому сочетает сотрудничество, строительство обороны и выбор между преимуществами изменения героя и связанным с этим риском.