Воздушный корабль, Лирия и дракон Вирн сопровождают капитана в Granblue Fantasy: Relink. Поиски легендарной Эсталусии приводят команду в небесный регион Зегагранде, где парящие острова связаны с первобытными зверями и загадочной Церковью Авии.

Для сражений формируется группа из четырёх персонажей. Их оружие и боевые стили различаются, поэтому состав определяет доступные сочетания действий. Бои идут в реальном времени; связующие атаки и цепные всплески позволяют согласовать действия команды.

Настройки помощи упрощают выполнение боевых действий. Full Assist автоматизирует значительную их часть, давая возможность сосредоточиться на движении и истории там, где этот режим доступен.

Дневник Лирии содержит сведения о местах и жителях мира. Личные эпизоды подробнее знакомят с членами экипажа и их прошлым. Исследование и развитие команды сопровождают сюжет, в котором местные тайны постепенно приобретают значение для всего небесного мира.