Заброшенный подземный комплекс в End of Abyss выглядит пустым, но следы чужого присутствия предупреждают об опасности. Изометрическая камера показывает индустриальные коридоры и технические тоннели, а резкие звуки усиливают напряжение во время исследования. Научно-фантастический хоррор чередует изучение пространства с перестрелками против биологических существ и машин.

Разные враги требуют внимательно следить за происходящим. Быстрые собакоподобные хищники преследуют героя; некоторые организмы после попаданий разделяются на несколько угроз. Автономные роботы патрулируют технические уровни, гигантские многоножки устраивают засады на подвесных мостах, а среди мутантов встречаются паразитические гуманоиды. В схватках важно правильно пользоваться доступным вооружением и реагировать на неожиданную атаку, продолжая путь через мрачные помещения комплекса.