В Deadnaut: Signal Lost игрок управляет одним солдатом, выполняющим опасные, нередко почти самоубийственные задания. Приказы ему отдают из удалённого командного центра. Действие происходит в холодном и враждебном космосе, где любая миссия способна стать последней: чтобы выжить, мало полагаться на быструю реакцию, а ошибка может обернуться катастрофой.

Бои здесь сочетаются с выживанием и требуют продуманной тактики, а не безрассудной атаки. Солдату противостоят не только враги: он сталкивается с неизвестностью, космическими ужасами и солдатами-изгоями. Исход задания определяется решениями игрока — например, продолжить ли исследование следующей комнаты или укрыться и укрепить позиции. Поэтому каждое действие нужно тщательно взвешивать; игру можно сравнить с шахматами, дополненными космическим ужасом.

Обстановка постоянно меняется. Бури безумия и нехватка ресурсов способны превратить удачный план в кошмар, так что важен каждый ход. Процедурные элементы делают миссии непохожими друг на друга, а прохождение — непредсказуемым и каждый раз новым. Игрок исследует заброшенные корабли и забытые луны, собирая находки: дополнительные оружие, броня и инструменты могут дать преимущество перед искусственным интеллектом.