Отова Досаки и Юки Итидодзи, героиня первых Dear Days, идут к турниру разными дорогами. В Cardfight!! Vanguard Dear Days 2 их истории пересекаются, а среди новых участников появляются Кисато Куга и Гаку Нидзё. Сюжетные дуэли дают повод постепенно разобраться в комбинациях и проверить собственную колоду в бою.

Для формата Standard доступно более трёх тысяч карт. Встроенное обучение объясняет ход партии, после чего выбранную колоду удобно испытать против компьютерного соперника. Такой матч позволяет проверить, какие карты срабатывают вместе, прежде чем менять состав колоды.

В оригинальной игре предусмотрены также рейтинговые встречи и комнаты для согласованных матчей. Рейтинг подходит для соревнования с разными соперниками, а комната позволяет выбирать, с кем проводить следующий поединок.