В Athanasy постапокалиптическая история подана как визуальная новелла: игрок исследует подземное убежище человечества, известное как «Город». Хоррор, биопанк и научная фантастика служат фоном для приключений Джосайи Кавиани, молодого математика. Он сообразителен и умеет продумывать тактику, однако ему приходится справляться с одиночеством и непониманием жителей поселения.

Путь по Городу будет долгим и непростым, а среди его обитателей встретятся яркие и загадочные личности. У каждого собеседника свои мотивы, характер и облик. В диалогах нужно выбирать ответы и действия; сделанный выбор может повлиять на судьбы второстепенных персонажей и развитие непростой сюжетной линии. Игроку предстоит исследовать тёмные тоннели и коридоры, пережить опасное приключение длительностью около 5–10 часов и открыть арты для специальной галереи. История предлагает несколько концовок — от негативной до кошмарной.