В WARSHIFT 2 командир может покинуть стратегический обзор и лично вступить в бой. Управление армией продолжается и при игре от третьего лица: приказы подразделениям доступны прямо из экшен-режима. Противником человечества выступает биомеханическая цивилизация, а фронт проходит через вулканические земли, морские глубины и космическое пространство.

Развитие войск требует одновременно добывать сырьё и поддерживать выработку энергии. Оборонительные башни связаны с поступлением тяжёлой техники; среди доступных сил есть летающие линкоры и авианосцы. Скопления врагов можно поражать ударом с орбиты, а оборону базы дополнять личными контратаками.

Боевые аватары различаются назначением. Бронированный Palladin рассчитан на штурм с пушечным огнём, лёгкий Raven — на быстрые обходные атаки, а трансформер T-Raptor действует в воздухе. Поддержку оказывают автономные дроны. Особые способности, разные виды оружия и устанавливаемые турели позволяют менять оснащение выбранного героя.

Кампания для одного игрока содержит 32 задания, знакомящие с совместным применением родов войск. Отдельные столкновения с компьютерным противником допускают настройку условий: их можно менять ради новых тактических ситуаций и повторных прохождений.