В Through the Void: Echoes традиционная ролевая система сочетается с автономной прогрессией персонажей. Развитие отряда продолжается постоянно: смена активного героя не прерывает занятия оставленных соратников. Они трудятся и приносят ресурсы в фоновом режиме, даже когда игрок находится вне сети.

Для подготовки персонажей предусмотрены три базовых класса, разделённые на девять специализированных направлений, и свыше ста боевых умений. Наряду с боевым развитием герои практически осваивают ремесленные дисциплины — это часть их долгосрочной подготовки.

Ремесленная подготовка включает добычу дерева и полезных ископаемых. Из выплавленных слитков делают броню, алхимия снабжает отряд лечебными эликсирами, а выращенный на ферме урожай используют для приготовления еды.

Накопленный потенциал персонажей и найденные комплекты экипировки пригодятся при штурме многоярусной Башни Бездны, насчитывающей 500 этажей. В смертельно опасных столкновениях отряд встретит исполинов, среди которых Минотавр, Ворлак и Хрона. Бои с ними требуют тщательно подгонять характеристики и проводить ритуалы Вознесения.

В игре есть стандартное приключение и хардкорный режим. В хардкоре гибель героя окончательна: имена павших бойцов навсегда заносятся в особый список почёта, где указывается ценность добытых ими реликвий.