Донателло, Рафаэль, Микеланджело и Леонардо отправляются навстречу приключениям, чтобы отомстить своему заклятому врагу Шредеру. На их пути — множество противников, включая солдат, воинов-трицератонов и каменные войска; сражения ведут к измерению Х.

У каждой черепашки свои навыки, особые приёмы и оружие. Их можно сочетать между собой и с умениями ниндзя, чтобы расправляться с бойцами клана Фут, приспешниками Шредера. По мере продвижения героям предстоит пересечь канализации и крыши городских зданий, добираясь от Манхэттена до Кони-Айленда.

Это экшен в жанре beat ’em up: герои преимущественно дерутся с многочисленными врагами врукопашную, двигаясь по городским улицам. Игра сочетает олдскульный геймплей с яркой пиксельной графикой и классической боевой механикой в духе 1980-х. Образы персонажей, предметы и транспорт вдохновлены одноимённым телешоу 1987 года; в игре также есть приключения и юмор. В сюжетном режиме можно использовать транспорт, а одновременно сражаться могут до четырёх игроков.