В Strange Horticulture игрок становится владельцем цветочного дела «Загадочные растения» в Андермире. Вокруг города раскинулись дремучие леса, где живут ведьмы, а в самом магазине героя ждут посетители и кот, за которым можно ухаживать. Таинственные происшествия и множество загадок превращают игру в двухмерный квест-головоломку: предстоит расследовать события и знакомиться с обитателями этого мира.

Работа в магазине сочетается с вылазками в лес за травами и другими растениями. Исследуя опасные чащи, игрок изучает местную флору и пользуется справочником с подсказками о тропах, растениях и животных, встречающихся в окрестностях. Среди находок могут оказаться яды и вещества с галлюциногенным действием.

Решения игрока влияют на дальнейшее развитие сюжета. Герой может сблизиться с колдуньями либо примкнуть к местной секте; выбранный путь и поступки также определяют, обретёт ли он магические способности или сойдёт с ума.