Горнодобывающая экспедиция в Repel The Rifts сталкивается с существами, приходящими через пространственные разломы. Игрок принимает командование обороной на чужой планете и постепенно исследует территорию, пытаясь установить источник вторжения. Удержать позиции необходимо для того, чтобы получить возможность продвинуться дальше.

Выбранный командир начинает с собственного набора из трёх башен и отличается активными и пассивными способностями. Это задаёт основу защиты, которую затем можно развивать улучшениями. Найденные инопланетные артефакты добавляют эффекты и помогают сочетать сооружения в единую систему.

Ночные нападения чередуются с разведкой. Открытые участки расширяют карту и меняют тактические условия: местность влияет на то, какие башни окажутся полезнее и где их разместить. После двадцати пяти пережитых ночей открывается бесконечный режим. Он позволяет продолжить испытание собранной обороны, когда основной рубеж уже пройден.