Оператор Блейк Лангерманн работает вместе с женой Линн над журналистским расследованием. След гибели молодой беременной женщины приводит их в удалённую часть Аризоны. В Outlast 2 поиск сведений оборачивается столкновением с замкнутой религиозной общиной, а после исчезновения Линн личная задача становится важнее репортажа.

Блейк пытается найти супругу среди противостоящих групп, чьи убеждения превращают его в цель преследования. Путь проходит через поселение и подземные участки; полученные сведения помогают понять, куда двигаться дальше. История постепенно раскрывает происходящее через встречи и сюжетные сцены.

Выживание требует уходить от преследователей, искать укрытия и внимательно обследовать доступное пространство. Герой остаётся уязвимым человеком, поэтому продвижение связано с выбором безопасного момента, а не с победой над каждым противником. Мрачная обстановка поддерживает историю о фанатизме и попытке вернуть близкого человека.