Harvest Island сочетает приключенческий экшен с фермерской симуляцией: здесь можно гладить коз, заботиться о коровах и стричь овец. Действие происходит на удалённом от цивилизации острове, но далеко от дома отходить нельзя.

Главный герой — мальчик Уилл, который живёт на острове с отцом Грейсоном и сестрой Самантой. Из любопытства он отправляется исследовать загадочные места, открывает новые формы жизни и встречает необычных животных в лесах и пещерах. Среди собираемых ресурсов — мечехвосты, креветки и яйца морских черепах.

Собранные кокосы, водоросли и другие предметы можно приносить в дар мистическим силам. Подношения нужны, чтобы заслужить благословение богов: их расположение влияет на игровой процесс, а выполнение их требований открывает новые способности. Уилл любит рыбачить, поэтому удочку можно достать в любой момент. Из полезных находок также создают инструменты и другие предметы, в том числе лестницу, топор и удочку, которые помогают исследовать остров.

В игре сменяются день и ночь, а со временем преобразуются ландшафты и погода. Некоторые животные покидают норы только при определённых погодных условиях или в конкретное время суток.