Игрок в HackHub берёт на себя роль цифрового бунтаря-взломщика: он раскрывает сетевые секреты и активно борется с электронным наблюдением. Стремясь изменить правила компьютерными взломами, персонаж выступает против установившегося порядка. Сюжетная задача игрока — целенаправленными действиями в киберпространстве обходить системы контроля и подрывать заведённый порядок в виртуальном пространстве.

Это одиночная игра с криминальными элементами. Для выполнения заданий игрок решает головоломки, набирает команды на клавиатуре, исследует сети и получает доступ к защищённым базам данных. Среди доступных средств — аналоги nslookup и nmap, а также hydra для подбора паролей; успешные операции зависят от умения пользоваться этими программами.

Тактические ситуации в заданиях охватывают путь от первичной разведки сетей до более сложного проникновения в хранилища данных. Выборы игрока непосредственно отражаются на ходе интерактивного повествования и определяют, какой из нескольких финалов ему достанется. С продвижением по сюжету задания усложняются и требуют от игрока стратегии и уже освоенных приёмов. Защита в миссиях обновляется, так что прежние методы могут не сработать: игроку нужно менять подход. Планирование помогает координировать тактику и общую стратегию.

Выполнение целей приносит награды. Награды позволяют улучшать имеющиеся утилиты или разблокировать дополнительные функции, расширяя набор средств для последующих операций. По мере игрового прогресса игрок принимается за кибероперации со всё более высокими амбициями.