В июне 1995 года Кэти Гринбрайар возвращается после долгой поездки по Европе. За время её отсутствия семья переехала. Вместо встречи в новом доме Кэти застаёт запертую дверь и записку младшей сестры Сэм. Внутри горит свет, но на зов никто не отзывается.

В Gone Home предстоит разобраться в событиях пропущенного года по тому, что осталось в комнатах. Школьная записка Сэм, письмо на столе родителей и сообщение на автоответчике рассказывают о разных сторонах семейной жизни. Вещи можно брать, поворачивать и подносить ближе, чтобы прочитать надпись или рассмотреть деталь. План дома помогает вернуться в спальню, кабинет или библиотеку, когда новая находка придаст смысл прежней.

На исследование обычно уходит несколько часов. Игрок сам задаёт темп и порядок осмотра, а записи сестры постепенно складываются в рассказ о том, что происходило здесь до приезда Кэти.