Собственный аппарат в Genome Guardian 2 можно собрать из сотен деталей. Выбор компонентов определяет его оружие и поведение: конструкции варьируются от неподвижных турелей до необычных экстрасенсорных мотоциклов с водяными распылителями. Есть и вариант огромного вращающегося механизма с двумя клинками. Новые виды вооружения и модули характеристик расширяют возможности такой сборки.

Проверять её предстоит в вертикальном скролл-шутере среди агрессивных микробов. Для выживания нужно собирать минералы и находить полипы, дающие усиления. Пространственные аномалии и внезапные мутации меняют условия боя, поэтому готовую конфигурацию приходится соотносить с происходящим вокруг.

Переработанный бесконечный режим поддерживает непрерывное противостояние. Психоделическое оформление мрачной Бездны сопровождает хаотичные перестрелки, в которых важны реакция и сочетание деталей нанобота. Удачная сборка повышает шансы справиться с микроскопическими противниками, но её всё равно нужно испытать в бою.