Crystal Caves HD возвращается как классический платформер с текстурами высокого разрешения. Игровой процесс не изменился: путешествия по пещерам и подземельям сохранены в том виде, в каком их задумали авторы оригинала. Игроку доступны те же возможности, что были у создателей «Хрустальных пещер HD».

Редактор уровней позволяет создавать собственные территории. Для проектирования локаций не требуются навыки программирования: объекты для размещения собраны в каталоге. Закончив работу, можно поделиться результатом с геймерами со всего мира. Кроме того, в игре есть список из 32 достижений, обязательных для прохождения на 100 процентов.

Главный герой Майло отправляется в длительное приключение по трём эпизодам классической игры. После прохождения всех эпизодов открывается добавленная создателями новая глава. В ней есть локации, которых не было в оригинале, и другие враги. Каждый уровень можно проходить на скорость, стремясь набрать максимум очков. Высокие результаты дают возможность побороться за первые места в онлайн-таблице лидеров.