В Chernobyl: Origins игрокам предстоит пережить мрачную историю, разворачивающуюся в Чернобыле на фоне аварии на ЧАЭС в 1986 году. Под управлением окажется ученый, работавший на станции в тот период; его путь проходит в гнетущей атмосфере безысходности.

Это point-and-click квест: нужно осматривать окружение, взаимодействовать с предметами и решать головоломки. Среди угроз — аномалии, мутанты и обезумевшие сотрудники станции. Они скрывают тайны и загадочные явления, проводя эксперименты над людьми.

Пробираясь через жуткие места, герой принимает решения, способные менять события и их исход. Игра состоит из шести основных эпизодов, где предстоит разгадывать тайны ЧАЭС, выживать среди опасных монстров и проходить испытания в форме головоломок и мини-игр. Сложные загадки соседствуют с моральными дилеммами, влияющими на человечество. Предусмотрены три концовки, полностью определяемые действиями игрока за всё прохождение.