В Astro Colony игрок выступает в роли колонизатора: вооружившись необходимыми инструментами и устройствами, он отправляется в галактику, чтобы основать сеть поселений для жизни. По мере продвижения окружающий мир открывает больше возможностей. Ценные ресурсы, непростой рельеф и необычный климат побуждают покидать освоенные места и продолжать поиски.

В начале исследований доступны базовые приспособления для добычи породы и изучения окружения. Позже конвейеры, солнечные батареи и перерабатывающие механизмы значительно облегчают работу. Добытые материалы сразу оказываются в инвентаре, а курсор показывает, где их можно применить. При установке двигателей и энергетических блоков игра уведомляет, что для полной активации все фрагменты требуется соединить проводами. У каждого объекта задан размер, поэтому до установки стоит оценить, насколько удобным будет выбранное расположение.

Отдельное дерево развития отображает все этапы прогресса колонии. Если из-за её размеров быстро передвигаться пешком становится трудно, можно установить рельсовую платформу и свободно ездить между секторами.