Sokoban: Ancient Ruins — трёхмерная пространственная головоломка в антураже забытых даосских святилищ. Игрок перемещает грузы по размеченным клеткам и должен доставить ящики на отмеченные целевые точки. Временных ограничений нет, но ошибочный ход может перекрыть проход или загнать предмет в угол. Блоки разрешено только толкать вперёд — тянуть их нельзя, поэтому каждое перемещение требует предварительного расчёта.

Кампания включает более 900 испытаний с постепенно возрастающей сложностью. Начальные этапы компактны, а в поздних головоломках предстоит разбираться с просторными площадками и множеством узких коридоров. Помимо обычных блоков, встречаются фигурные многоклеточные объекты: они занимают сразу несколько ячеек и требуют иного подхода к маневрированию. Ошибки можно исправить мгновенной отменой действий или полной перезагрузкой текущей локации.

Маршруты проходят через сменяющиеся трёхмерные декорации: бамбуковые рощи, заснеженные поля, кристальные шахты, лавовые пещеры, парящие небесные города, цветущие сады сакуры и руины островных храмов. Для прохождения доступны 9 сменных персонажей. Игра сохраняет неспешный медитативный темп и сосредоточена на обдумывании комбинаций.