Sealed Fortress переносит игроков в мрачные подземелья распавшейся Велитианской империи. Здесь дают о себе знать последствия ритуала, проведённого королём Нонцхеем: магические потоки преобразили старинную обитель, где четыре могущественных арфе пятьдесят два года назад заточили безумного правителя. Отважные искатели пробираются в закрытые залы за украденным артефактом погибшей цивилизации и встречают загадки её прошлого.

Путь через взаимосвязанные, нелинейно устроенные уровни сопровождают пошаговые битвы и вручную созданные декорации, поддерживающие ощущение угрозы. Между схватками отряд может восстановиться у общего супового котла, но впереди его поджидают жестокие бои с кошмарными существами хаоса.

Выживание требует бережно делить скудные запасы и следить за выносливостью бойцов, чтобы подготовить их к новым опасностям. Найденная в подземельях экипировка открывает персонажам боевые умения, а редкие трофеи позволяют улучшать снаряжение группы. Для сражений собирают сбалансированный состав из трёх действующих бойцов.

Исследуя запутанные проходы, можно обнаружить спрятанные сокровища и старинные артефакты. Тактические пошаговые столкновения проверяют умение справляться с противниками при минимальном количестве числовых параметров; продвижение же зависит от изучения соединённых между собой уровней.