Prey представляет собой научно-фантастический immersive sim от первого лица. Игра работает на CryEngine 4, обеспечивающем качественную графику.

История разворачивается в мире, где СССР сохранился, Джон Кеннеди пережил покушение, а развитие космических исследований резко ускорилось. Благодаря этому человечество встретило тифонов — инопланетян, настроенных враждебно к людям. В ответ ведущие державы, включая США и СССР, объединились, чтобы создать общий космический флот.

Центральное место действия — станция «Клетка», расположенная на дальней лунной орбите. Там проводят эксперименты над захваченными тифонами: исследуют их устройство и ищут уязвимости. На станции и проходит игра.

Нелинейный сюжет ставит игрока перед последствиями решений героя; перед началом можно выбрать его пол. По мере развития персонажа по фамилии Ю открываются, в частности, способности тифонов. Одна из них позволяет принимать облик множества окружающих предметов — например, чашек или мячей.

Исследуя уровни, нужно собирать ресурсы для создания предметов, находить новое огнестрельное оружие и ключ-карты. Последние отпирают прежде закрытые участки станции. В некоторые ранее недоступные места можно попасть, выйдя в открытый космос в специальном скафандре.