В Only Up 3 Джеки поднимается через трущобы, после чего оказывается на борту космического корабля, направляющегося к острову Грекко. На новой планете он вновь устремляется вверх: так начинается испытание, построенное на вертикальном продвижении в необычном окружении. В основе игрового процесса — непрерывный подъем через локации.

Игрок сопровождает героя по маршруту, который включает заброшенные деревни, здания с паранормальными явлениями, засушливые пустыни и пиратские корабли на высоте в тысячи миль. По мере продвижения появляются военные базы и ожившие египетские пирамиды. Все эти места ведут к вершине острова; там, возможно, Джеки узнает о своем предназначении. Для движения он бегает, карабкается по объектам и прыгает между платформами.

На пути встречаются ускорители: одни действуют подобно батутам, другие позволяют воспользоваться короткими обходными маршрутами и быстрее перемещаться. Собственное ускоряющее устройство Джеки дает ему возможность совершить двойной прыжок и преодолеть широкие промежутки. Контрольных точек и сохранений в игре намеренно нет, поэтому после падения герой может оказаться далеко позади. Чтобы завершить игру, необходимо достичь самой высокой точки карты.