В Freedom Wars Remastered человечество живёт среди руин: уцелевшие заперты в огромных городах-тюрьмах, Паноптиконах. Эти места не только служат убежищами, но и олицетворяют падение цивилизации. Игрок становится Грешником, которому назначен миллион лет наказания лишь за само существование. Уменьшить срок можно, выполняя опасные задания, в том числе спасая мирных жителей от Похитителей — чудовищного биооружия.

Похитители огромны и агрессивны, так что любая миссия сопряжена с серьёзным риском. Игра соединяет быстрые сражения со стратегическим подходом. В бою и перемещении помогает Thorns-граплинг: с его помощью можно ловко передвигаться по местности и атаковать противников. Эта механика делает схватки подвижнее и поощряет разумно использовать окружение.

Торны пригодны для разных задач: ими можно притянуться к противнику и перейти к ближней атаке или проложить маршрут по сложному ландшафту. Благодаря этому бои допускают более творческий подход. Также предусмотрена глубокая настройка персонажа: Грешник может подобрать её под свой стиль игры, привнося в него дополнительные стратегические решения.