В Dystopian Pet Simulator исследователь изучает опасные уровни разрушенного технологического комплекса, управляя терминалом. На заброшенных металлических сооружениях нужно осторожно перемещаться, преодолевать сложные прыжки и следить за обстановкой. В поисках аномальных существ важно вовремя поймать их сетью и доставить на базу живыми: уничтожать мутантов невыгодно, ведь в изоляции они производят ценные ресурсы и опыт.

Исследовать индустриальные глубины можно одному или командой до четырёх человек. В совместных вылазках участники либо поровну принимают на себя смертельные опасности, либо соперничают за наиболее редкую добычу. Глубина проникновения влияет на рыночную цену существ: чем дальше удаётся зайти, тем она выше.

Модернизация персонального терминала помогает лучше контролировать подземные уровни. Можно расширить отсеки для пойманных мутантов, улучшить подвижность для вертикального исследования и ускорить получение пассивного дохода от ценных трофеев. Скрещивание нескольких питомцев позволяет выводить дорогие мутации, а повышение продуктивности увеличивает общую отдачу от содержащихся в изоляции созданий. Для поиска ценных экземпляров предусмотрено сканирование подземелий; прочная сеть нужна, чтобы быстро ловить существ и безопасно перевозить их.