Aquamarine — приключенческая игра на выживание с элементами roguelike. Героиня, одна из космических путешественников, которых называют Искателями, терпит крушение на полностью покрытой водой планете. Ей удаётся добраться до небольшого острова посреди океана, но корабль тонет. Чтобы найти дорогу домой, ей предстоит исследовать незнакомый мир.

В открытом мире обитают разные существа и скрыто множество головоломок. В море встречаются только амфибии. Изучая экосистему планеты, героиня постепенно раскрывает её тайны: узнаёт, как выращивать растения и как среда отвечает на её действия, а также учится взаимодействовать с ней.

Игра вдохновлена научной фантастикой 1970-х и историями о робинзонах. Решив погрузиться в океан и исследовать его глубины, героиня обнаруживает новые секреты. Один из них объясняет истинную причину её появления на планете.